有“中国佛门医宗”之誉的少林药局始建于公元1217年，早在明代就已设立健全的医疗机构和完备的医事制度，并以多年行医治病经验为基础，在历代高僧不断的钻研和努力下，配制出禅医秘传古方，千年传承。
武以寺名，寺以武显，历代高僧大都法、武、医兼通，效国利民，名闻于世（《少林寺秘方集锦》），昙宗、惠易善于伤科医术，开创了少林武术伤科，少林伤科至明清得到大发展。
五代以后，中国佛教在衰微中延续。五代十国时期高僧福居特邀十八家武术家到少林寺演练三年，各取所长，汇集成《少林拳》，少林武术得到发殿，促进少林伤科发展。这时著名僧医有福居、智广。智广（920年卒），精于伤科，尤熟谙人体经脉，善点穴治病，凡筋脉拘挛、跌破之类、损伤之类，皆以竹片为杖，捆其痛处，或兼施药液外搽，丸散内服，常获立愈的效果。
明代，明太祖出身僧侣。明代南倭寇侵扰，总制胡宗宪变用少林僧兵抵御外侵。抗倭名将俞大猷也曾到少林寺传授棍术，稳中有降显神通。少林月空和尚率僧兵赴东南抗倭，自备军中急救良药，如少林行军散、八珍丹，少林著名僧医有智正、智淳。智正收集明以前寺院有效秘方，编著了《少林寺秘方》，墨本秘不外传。明嘉靖二年（公元1523年），异远真人著《跌损妙方》问世，少林伤科的真传秘方为世人所知。
自北魏到明清，少林寺屡经敕建，遍布南北，数达十余座。明末清初，居福建少林传承僧人以寺为依托成为反清复明的秘密基地，屡遭清廷镇压，寺院落被焚烧，佛教洪门众徒四方逃散，从而分布大江南北，自立门户，广收徒弟，少林武术、伤科在民间发展。这时期伤科秘方著述传抄甚多，其法多宗少林伤科，师承各异有所发挥而分支。著名僧医有字宽、湛举、湛化、南洲、本园、了然、毛公、太双、梅亭等。湛举、湛化两位僧医进一步补充、完善整理少林寺伤科秘方为《少林跌打损伤秘方》，制成木刻版，藏于法堂，但后被焚。
清末以后期间著名僧医有淳济、寝勤、贞俊、侦绪、恒林、妙月。民国年间，卢俊善武精医，著有《少林秘真求襄》。妙月（公元1883~1994）任泉州崇福寺主持，以寺行医，擅长跌打损伤，此外清供还有没有撰著者的《少林寺伤科秘方》、《少林专真传伤科秘方》、《少林寺跌打损伤奇验全方》。民间有《少林寺十二时辰十二穴秘方》、《少林寺军阵伤科秘传》、《少林寺跌打伤科万应方》等流传。
到80年代，少林寺成立少林拳谱编写委员会，少林寺第36世住持德禅法师，将自己六、七十年的临床经验，结合寺院僧医的验方、秘方、单方，传授给皈依弟子德虔，先后整理、编著了《少林寺秘方集锦》、《少林寺伤科秘方》、《少林点穴法》等书，全拽少室秘藏，惠国利民。这是少林寺僧医伤科的结晶，从中可领略治疗水平概况，了解少林伤科治伤特色。
中国少林医学源远流长，博大精深，是中华民族传统文化中珍贵的遗产，它具有完备的理论，丰富的实践，千年的历史，在古代经过少林寺僧千锤百炼的秘方汇集成书流传至今。
《少林寺秘方真传》一书以伤科为主，是中国传统医学中精粹而神秘的组成部分。经过多年收集珍藏大量的少林秘方，不断的完善加以整理分列为：急救方、止血方、跌打损伤方、药酒方、膏药方、接骨方、练功方等。对各种损伤有奇异的效果。
